O novo ciclo do Museu iniciou-se em 2000, após a descoberta de gravuras rupestres no vale do Rio Ocreza. Daí em diante, uma nova direção e uma equipa mais alargada, iniciou a reorganização e o inventário. O tema central do museu passou a ser a arte rupestre e as temáticas do simbólico e do sagrado ao longo do tempo, articuladas com a ideia de risco e paisagem.

De agosto de 2003 a março de 2005 todo o edifício foi reestruturado e foi inaugurada a exposição “Um risco na Paisagem – Artefactos, lugares e modos de vida nas origens do agro-pastoralismo”. Este tema foi selecionado porque este é um acervo de importância nacional (Mação situa-se no eixo central de atravessamento do Rio Tejo por comunidades que optam pelo agro-pastoralismo e também porque a agricultura e o trabalho da terra são as bases identitárias das populações, possibilitando um discurso antropológico percetível aos visitantes.

O museu de Mação desde a sua restruturação tem vindo a ser palco de oficinas, exposições, eventos e programas de socialização do conhecimento.

Todo este processo inclui uma estreita colaboração com outras entidades maçaenses, como o Agrupamento de Escolas Verde Horizonte, a Biblioteca Municipal ou a Universidade Sénior.

Esta rede local reforçada tem-se vindo a articular com a rede nacional e internacional do Museu, que envolve a parceria com o Instituto Politécnico de Tomar e com mais de 50 universidades da Europa, Américas, África e Ásia.

Foi este processo de colaboração e convergência que levou ao reconhecimento de Mação, em 2016, como membro da “Rede UNESCO de Cidades da Aprendizagem”.

O Museu de Arte Pré-Histórica de Mação embora actuando em diversas áreas (investigação, gestão, conservação, valorização…), tem como papel principal propiciar aos seus utilizadores espaços de encontro, de reflexão, de construções de conhecimento e de novos conceitos, e de elaboração de juízos críticos. A diversidade dos seus utilizadores e interlocutores resulta em discursos que podem ser distintos, mantendo todavia as bases temáticas das exposições do Museu. 

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